カスタム投稿タイプとカスタムフィールドを使って独自の投稿ページを作成する人は多いかと思いますが、その際CPT UI(Custom Post Type UI)を使用して構築していたら、投稿画面上から「カテゴリー」の項目が消えてしまいました。
CPT UI(Custom Post Type UI)を確認


CPT UIの該当「投稿タイプの追加と編集」の下部に「設定」の項目があります。
その中にタクソノミーという項目がありますので「カテゴリー(WP コア)」をチェックします。
以上で無事表示されるかと思います。